Центр колективного користування науковим приладами ІПКiК НАН України

Центр колективного користування науковим приладами(далi ЦККП або Центр) в ІПКіК НАН України було створено за Наказом директора №7/1 від 19.02.2024 та рішенням Вченої ради ІПКіК НАН України протокол №2 від 26.02.2024,  як структурний підрозділ у складі Відділу кріобіохімії ІПКіК НАН України,  відповідно до постанови Президії НАН України №302 від 10.12.2003 та розпорядження Президії НАН України №99 від 13.04.2004.

Цілі та завдання Центру колективного користування ІПКіК НАН України

ЦККП створено з метою забезпечення найбільш раціонального використання унікальних та коштовних наукових приладів та обладнання, вироблених як вітчизняними, так і імпортними виробниками, яке неможливо або недоцільно придбати кожній науковій установі окремо з централізованих коштів, спільних коштів установ та організацій, або інших джерел фінансування НАН України.

Головним завданням Центру є надання науковцям НАН України можливості проводити дослідження на сучасних наукових приладах та обладнанні, які обслуговуються кваліфікованим персоналом, здатним підтримувати обладнання у високоякісному робочому стані та надавати консультативні послуги.

Області експериментальних досліджень

ЦККП ІПКіК НАН України проводить експериментальні роботи в галузі кріобіології, кріомедицини, клітинної та молекулярної біології, цитології, гістології, гематології, імунології, мікробіології, біотехнології та інших. Крім того, Центр надає кваліфіковані послуги вченим установ відділень НАН України, а також іншим науковим та освітнім установам у суміжних галузях науки, освіти, медицини, сільського господарства та харчової промисловості.

Документи

Принципи функціонування Центру та порядок отримання послуг визначаються документами: «Положення про ЦККП»

Постанова Вченої ради ІПКіК НАН України №2 від 26.02.2024 Положення про ЦККП ІПКіК.

Наукове обладнання

У складі Центру доступні для використання такі високотехнологічні прилади:
1. Лазерний скануючий конфокальний мікроскоп LSM 510 META (виробник Carl Zeiss, Німеччина).
2. Протоковий цитофлуориметр FACS Calibur (виробник  Becton Dickinson, США).

Послуги ЦККП Лазерний скануючий конфокальний мікроскоп LSM510

Лазерний скануючий конфокальний мікроскоп LSM510 META (виробник Carl Zeiss, Німеччина, рік випуску 2004) призначений для флуоресцентної візуалізації структури різноманітних фіксованих або живих біологічних зразків, а також дослідження динамічних процесів і колокалізації біомолекул. Мікроскоп LSM510 META є універсальною системою, здатною вирішувати широкий спектр дослідницьких завдань з використанням методів лазерної скануючої конфокальної мікроскопії з тривимірною просторовою, тимчасовою та спектральною роздільною здатністю.
Веб-сторінка фірми-виробника: https://www.zeiss.com/corporate/en/home.html .                                           

ЦККП надає послуги за такими напрямками:

1) Лазерна конфокальна скануюча та флуоресцентна мікроскопія.
2) Консультації з фахівцями ЦККП щодо проведення досліджень, допомога у плануванні та проведенні досліджень/вимірів ваших зразків на обладнанні конфокального мікроскопа LSM510 MET.
3) Технічне забезпечення роботи конфокального мікроскопа LSM510 META.

Відповідальний за організацію роботи Лазерного конфокального мікроскопа LSM510 META:
к.б.н., с.н.с. Ігорь Коваленко
Відділ низькотемпературного консервування
Телефон: (057)-373-4143
Електронна пошта: I.F.Kovalenko@nas.gov.ua

Список основних опублікованих праць співробітниками ЦККП

Список основних публікацій ЦККП ІПКiК, в яких були використані результати, отримані за допомогою Лазерного скануючюго конфокального мікроскопа LSM510 META (Carl Zeiss, Німеччина):

• Gordiyenko OI, Kovalenko IF, Rogulska OY, Trufanova NA, Gurina TM, Trufanov OV, Petrenko OY. Theory-based cryopreservation mode of mesenchymal stromal cell spheroids. Cryobiology. 2024. Jun;115:104906. doi: 10.1016/j.cryobiol.2024.104906.
• Todrin AF, Kovalenko IF, Ye.I. Smolyaninova OV, Timofeyeva LI, Popivnenko, Gordiyenko OI. Determination of cell membrane permeability coefficients: Comparison of models in the case of oocytes. (2023) Cryobiology 113, 104789. https://doi.org/10.1016/j.cryobiol.2023.104789
• Trufanova N, Rogulska O, Trufanov O, Mazur S, Kovalenko I, Petrenko A. (2023) Cryopreservation of mesenchymal stromal cells spheroids by vitrification
• Cryobiology, Volume 113, article id. 104751. doi:10.1016/j.cryobiol.2023.104751
• Chernobai NA, Kadnikova NG, Vozovyk KD, Rozanov LF, Kovalenko, IF. Effects of salt stress and cooling regimes on the pigment composition of Dunaliella salina cells. (2023). Biophysical Bulletin, (49), 34-42. https://doi.org/10.26565/2075-3810-2023-49-03
• Repina S, Kovalenko I, Nardid O. Temperature dependence of erythrocyte osmotic response to an artificial hypobiosis state of homoiothermal and heterothermal mammals. (2022) Cryobiology 109, 63.
• Chernobai NA, Kadnikova, N. G., Vozovyk, K. D., Rozanov, L. F., Kovalenko, I. F., & Kot, Y. G. Temperature-salt stress increases yield of valuable metabolites and shelf life of microalgae. (2022). Biophysical Bulletin, (48), 7-17. https://doi.org/10.26565/2075-3810-2022-48-01
• Smolyaninova Y, Shigimaga V, Popivnenko L, Kovalenko I. Cell-to-Cell Adhesion and Electrical Parameters of Murine Embryo Membranes After Cryopreservation by Vitrification. Problems of Cryobiology and Cryomedicine. (2022) 32 (4), 256–266-256–266.
• Shevchenko N, Chernobai N, Vozovyk K, Kovalenko I, Rozanov L. Determination of microalgae Chlorococcum dissectum cells permeability coefficient for cryoprotectants. (2022) Cryobiology, 109, 60.
• Moisieiev A, Kovalenko I, Kovalenko S, Bozhok D, Gordienko O. Dynamics of dimethyl sulfoxide penetration into L929 cells and L929-based spheroids.  Probl.Cryobiol.Cryomed. 2021; 31(4):316–325. https://doi.org/10.15407/cryo31.04.316
• Moisieiev AI, Kovalenko IF, Bozhok GA, Gordiyenko OI. Theoretical approaches to determination of optimal cryopreservation regimens for cell spheroids of different cultivation terms. 2021/12/29 Biophysical Bulletin Випуск 46 7-22. DOI: https://doi.org/10.26565/2075-3810-2021-46-01
• Kuleshova L, Kovalenko I, Kovalenko S, Tsibulko T, Gordienko O. Transport characteristics of plasma membranes of PK-15 passaged cells. Probl. Cryobiol. Cryomed. 2021; 31(1):014–022. https://doi.org/10.15407/cryo31.01.014
• Goltsev АМ, Babenko NM, Gaevska YO, Bondarovich MO, Оstankov MV, Kovalenko IF, Malyukin YV, Klochkov VK. Antitumor efficiency of hybrid nanocomplexes depends on the time of their interaction with ehrlich carcinoma cells. Nanosistemi, Nanomateriali, Nanotehnologii. 2020, т. 18, № 3, pp. 487–503.
• Klochkov VL, Goltsev AM, Malyukin YV, Babenko NM, Gaevska YO, Bondarovych MO, Dubrava TG, Kovalenko IF, Ostankov MV. Antitumor activity of spherical nanoparticles GdYVO4:Eu3+ depends on pre-incubation time.  Applied Nanoscience. 2020; 10(4). DOI:10.1007/s13204-020-01284-3
• Deng B, Kireev V, Melentyeva K, Kovalenko I, Pakhomov O. Histology of Cryopreserved Neonatal Rat Testes After Intratesticular Allotransplantation. Problems of Cryobiology and Cryomedicine. 2020; 30(1), pp.34-46. DOI:10.15407/cryo30.01.034
• Chernobai N, Kadnikova N, Kovalenko I. THE ROLE OF COLD ADAPTATION IN CRYOPRESERVATION OF DUNALIELLA SALINA TEOD. MICROALGAE. Advances in Biology & Earth Sciences Vol.4, No.2, 2019, pp.119-127.
• Goltsev A, Malyukin Y, Babenko N, Gaevska Y, Bondarovych M, Kovalenko I, Dubrava T, Klochkov V.  Mechanisms of antitumor effect of nanomaterials based on rare earth orthovanadates. Nanooptics and Photonics, Nanochemistry and Nanobiotechnology, and Their Applications: Selected Proceedings of the 7th International Conference Nanotechnology and Nanomaterials (NANO2019), 27–30 August, 2019, Lviv, Ukraine.
• Ulizko PY, Bobrova OM, Nardid OA, Zubov P, Kovalenko IF, Kuchkov VM, Vodopyanova LA. (2019). Cryopreservation of Equine and Bovine Erythrocytes Using Combined Protective Media. Problems of Cryobiology and Cryomedicine, 29(3), 255–265. https://doi.org/10.15407/cryo29.03.255
• Kovalenko I, Shckorbatov Y, Miroshnik D. Response to Doxorubicin of Exfoliated Human Buccal Epithelium Cells: Comparison of  Three Methods of Cell Staining and Calcium Assessment. 2018. Current Drug Discovery Technologies, 15, Issue 2, pp.142-148.  DOI: 10.2174/1570163815666171206125949
• Plaksina KM, Sidorenko OS, Legach YI, Kovalenko IF, Bozhok GA. Expression of  g-III-tubulin in the neonatal adrenal cell culture: comparison of monolayer and 3D-culture. The Journal of VN Karazin Kharkiv National University. Series “Biology”, 2017, issue 28. DOI: 10.26565/2075-5457-2017-28-9
• Zemlianskykh NG, Kovalenko IF, Babijchuk LA. Peculiarities of Modifications in Geometric Parameters and Changes in Osmotic Fragility of Human Erythrocytes Following Their Exposure in Sucrose and PEG-1500 Solutions.  Probl. Cryobiol. Cryomed. 2017; 27(4):296-310. https://doi.org/10.15407/cryo27.04.296

Послуги ЦККП Протоковий цитофлуориметр FACS Calibur

ЦККП Протоковий цитофлуориметр FACS Calibur (виробник Becton Dickinson, США, рік виробництва 2004) є сучасним комплексом наукового обладнання, призначеним для вирішення широкого спектру клінічних та наукових завдань, таких як визначення параметрів клітинного імунітету (імунофенотипування), моніторинг імуностанів, підрахунок абсолютної кількості клітин різних субпопуляцій, визначення CD34+-клітин, підрахунок ретикулоцитів, аналіз стовбурових клітин, ДНК-аналіз, визначення функціонального стану клітин імунної системи (внутрішньоклітинних та позаклітинних форм цитокінів, фагоцитарної функції клітин), вивчення апоптозу, аналіз клітинного циклу, а також проведення досліджень у галузі генетики та протеоміки, та ін.
Веб-сторінка виробника: https://www.bdbiosciences.com/en-eu.

ЦККП надає послуги по таких напрямках:

1. Протокова цитофлуориметрія зразків біологічних об’єктів.
2. Консультації з фахівцями ЦККП щодо проведення досліджень, допомога у плануванні та проведенні досліджень/вимірів ваших зразків з застосуванням Протокового цитофлуориметра FACS Calibur.
3. Технічне забезпечення роботи Протокового цитофлуориметра FACS Calibur. 

Відповідальний за організацію роботи Протокового цитофлуориметра FACS Calibur:
к.б.н., с.н.с. Павло Зубов
Відділ кріоцитології
Телефон: (057)-373-4143
Електронна пошта: P.M.Zubov@nas.gov.ua

Список основних опублікованих праць співробітниками ЦККП

Список основних публікацій ЦККП IПКiK в яких були використані результати, отримані за допомогою Протокового цитофлуориметра FACS Calibur (BD, США):

1. Ніпот ОЄ, Єршова НА, Чабаненко ОО, Зубов ПМ, Шпакова НМ. Вплив амфіфільних сполук на форму та ериптоз еритроцитів людини в умовах постгіпертонічного шоку. Фізіологічний журнал, 2024, Т. 70, № 2, С. 59-66.
2. Lytvyn S, Vazhnichaya E, Kurapov Y, Semaka O, Babijchuk L, Zubov P. Cytotoxicity of magnetite nanoparticles deposited in sodium chloride matrix and their functionalized analogues in erythrocytes. OpenNano. 2023; Vol. 11: 100143. https://doi.org/10.1016/j.onano.2023.100143
3. Zubov P, Zubova O, Babijchuk L. Trolox Antioxidant as a Factor in Stabilization of Human Cord Blood Nucleated Cells During Cryopreservation. Problems of Cryobiology and Cryomedicine. (2023). 33(2), 122–132. https://doi.org/10.15407/cryo33.02.122
4. Бабійчук ЛО, Гуріна ТМ, Зубов ПМ, Зубова ОЛ, Макашова ОЄ. Спосіб кріоконсервування ядровмісних клітин кордової крові людини. Патент. №151698. Україна: МПК A01N 1/02 (2006.01), G01N; заяв. та патентовласник ІПКіК НАНУ. № заявки u202200066; заявл. 06.01.2022; опубл. 31.08.2022.
5. Ніпот ОЄ, Шапкіна ОО, Зубов ПМ, Орлова НВ, Шпакова НМ. Роль етапу дегідратації в розвитку постгіпертонічного гемолізу еритроцитів ссавців. Біологія тварин. 2021; 23(2): 32–6.
6. Makashova O, Mykhailova O, Zubova O, Zubov P, Babijchuk L.  Glutathione Antioxidant Increases Resistance of Cord Blood Nucleated Cells During Cryopreservation with Dimethyl Sulfoxide. Problems of Cryobiology and Cryomedicine. (2020). 30(1), 58–67. https://doi.org/10.15407/cryo30.01.058
7. Marchenko IА, Babiichuk LO, Mishyna MM, Makieieva NI, Zubov PM. Peculiarities of leukocyte apoptosis modulation in children with pyelonephritis. Regulatory Mechanisms in Biosystems, (2020). 11(1), 88-92. https://doi.org/10.15421/022012
8. Ulizko P, Bobrova O, Nardid O, Zubov P, Kovalenko I, Kuchkov V, Vodopyanova L. Cryopreservation of Equine and Bovine Erythrocytes Using Combined Protective Media. Probl Cryobiol Cryomed. 2019. V. 29. No. 3, pp. 255-265. https://doi.org/10.15407/cryo29.03.255
9. Onishchenko AI, Tkachenko AS, Kalashnyk JM, Zubov PV, Gorbach TV, Babijchuk LA, Nakonechna OA. Distinguishing modes of leukocyte cell death using flow cytometry in patients with chronic rhinosinusitis without nasal polyps. “MEDICAL JOURNAL” (Serbian Medical Society Section Kragujevac). 2019. Vol. 53, № 2. P. 43-48. doi:10.5937/mckg53-17381
10. Макашова ОЄ, Зубов ПМ, Зубова ОЛ, Бабійчук ЛО. Аналіз структурно-функціонального стану гемопоетичних прогеніторних клітин кордової крові людини після кріоконсервування з ДМСО і антиоксидантами та перенесення до умов, що моделюють фізіологічні. Вісник проблем біології і медицини. (2018). Вип. 1, Т. 1(142). pp. 384–388. DOI 10.29254/2077-4214-2018-1-1-142-384-388
11. Ulizko PY, Bobrova OM, Nardid OA,   Zubov PM, Hovorova YS, Kovalenko IF. Evaluation of efficiency of equine erythrocytes cryopreservation using fluorescent dyes. Альманах науки. 2018. № 4(13). pp. 14–17.
12. Semionova EA, Chabanenko EA, Orlova NV, Zubov PM, NM Shpakova. About Mechanism of Antihemolitic Action of Chlorpromazine Under Posthypertonic Stress in Erythrocytes. Problems of Cryobiology and Cryomedicine. (2017) 27(3), 219–229. https://doi.org/10.15407/cryo27.03.219
13. Макашова ОЄ, Зубова ОЛ, Зубов ПМ, Мігунова РК,  Бабійчук ЛО. Кріоконсервування гемопоетичних прогеніторних клітин кордової крові в кріозахисних середовищах, що містять різні концентрації ДМСО та антиоксидантів. Український журнал медицини, біології та спорту. (2017) № 2(4). pp. 234-238.
14. Makashova OY, Zubova OL, Zubov PM. Role of Antioxidants to Increase Survival and Viability of Cryopreserved Cord Blood Hematopoietic Progenitor Cells. Problems of Cryobiology and Cryomedicine. (2017) 27(2), 176. https://doi.org/10.15407/cryo27.02.176